「ポリペプチド」はギリシャ語の「ポルス」（多くの）と「ペプトス」（消化された）から由来します。

「ポリペプチド」は20世紀に「ポリ-」と「ペプチド」の組み合わせから形成されました。

最初はアミノ酸の鎖を指し、この意味は現代でもほぼ同じです。